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Original y traducción

Moléculas diseñadas con IA frenan una enzima humana usada por virus

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Original · inglés
AI-designed molecules block a human enzyme viruses use, in the lab
Traducción · español
Moléculas diseñadas con IA frenan una enzima humana usada por virus
Original · inglés
Six AI-generated fragments were tested in the lab, and all three predicted to be active inhibited the enzyme DHPS.
Traducción · español
Se probaron en laboratorio seis fragmentos generados por IA, y los tres previstos como activos inhibieron la enzima DHPS.
Original · inglés
Two active fragments reached IC50 values of 31.2 and 49.1 μM, typical for early-stage drug hits.
Traducción · español
Dos fragmentos activos alcanzaron valores de CI50 de 31,2 y 49,1 μM, típicos de los aciertos iniciales en el desarrollo de fármacos.
Original · inglés
The team says mechanism, selectivity, toxicity and animal tests are still needed before any drug candidate.
Traducción · español
Según el equipo, aún se necesitan estudios sobre el mecanismo, la selectividad, la toxicidad y ensayos en animales antes de cualquier candidato a fármaco.
Original · inglés

Viruses mutate fast, and a drug that attacks one of their proteins can stop working once the virus learns to resist it. A team at Korea University tried another route: instead of hitting the virus, it went after a human enzyme that the virus needs. The researchers, led by Kwang Yeon Hwang of the College of Life Sciences and Biotechnology and Hong-Rae Kim of the College of Medicine, call this host-directed therapy, an emerging approach that treats an infection by targeting the body's own biological pathways.

Traducción · español

Los virus mutan rápidamente, y un fármaco que ataca una de sus proteínas puede dejar de funcionar cuando el virus aprende a resistirlo. Un equipo de la Universidad de Corea probó otra vía: en lugar de atacar al virus, apuntó a una enzima humana que el virus necesita. Los investigadores, dirigidos por Kwang Yeon Hwang, del Colegio de Ciencias Biológicas y Biotecnología, y Hong-Rae Kim, de la Facultad de Medicina, denominan a este enfoque terapia dirigida al huésped, un planteamiento emergente que trata una infección actuando sobre las vías biológicas propias del organismo.

Original · inglés

The enzyme is DHPS, deoxyhypusine synthase. It takes part in a chemical modification called hypusination, which activates a protein known as eIF5A. That process, the researchers explain, is important for the replication of a broad range of viruses, including HIV-1 and SARS-CoV-2. To find molecules that block DHPS, the team benchmarked 13 machine-learning models for predicting binding scores and 10 methods for generating new molecules, all against the same target. Among the prediction models, OOF-Stacking performed best overall. Among the generators, RL-Design reached a predicted hit rate of 92.02%, and 98.0% of its top-ranked molecules passed a standard drug-likeness threshold. These are computed predictions, not laboratory results.

Traducción · español

La enzima es DHPS, desoxihipusina sintasa. Participa en una modificación química llamada hipusinación, que activa una proteína conocida como eIF5A. Según explican los investigadores, ese proceso es importante para la replicación de un amplio grupo de virus, entre ellos el VIH-1 y el SARS-CoV-2. Para encontrar moléculas que bloqueen DHPS, el equipo comparó 13 modelos de aprendizaje automático para predecir las puntuaciones de unión y 10 métodos para generar nuevas moléculas, todos frente a la misma diana. Entre los modelos predictivos, OOF-Stacking obtuvo el mejor resultado global. Entre los generadores, RL-Design alcanzó una tasa de acierto predicha de 92,02 %, y el 98,0 % de sus moléculas mejor clasificadas superó un umbral estándar de semejanza con fármacos. Son predicciones computacionales, no resultados de laboratorio.

Original · inglés

The laboratory test is where the predictions met reality. The researchers picked six fragments, small compounds of 140 to 190 daltons, a unit of molecular mass: three predicted to be active and three predicted to be inactive. All three predicted-active fragments inhibited DHPS, and none of the predicted-inactive ones did. Two of the active fragments gave measurable IC50 values of 31.2 and 49.1 μM, a measure of inhibition strength that the team places within the typical range for initial fragment hits. An X-ray co-crystal structure, which shows how a molecule sits inside a protein, also placed one compound at the entrance of the enzyme's substrate and NAD-binding pocket.

Traducción · español

La prueba de laboratorio es donde las predicciones se encontraron con la realidad. Los investigadores eligieron seis fragmentos, compuestos pequeños de entre 140 y 190 daltons, unidad de masa molecular: tres previstos como activos y tres previstos como inactivos. Los tres fragmentos previstos como activos inhibieron DHPS, y ninguno de los previstos como inactivos lo hizo. Dos de los fragmentos activos dieron valores de CI50 medibles de 31,2 y 49,1 μM, una medida de la fuerza de inhibición que el equipo sitúa dentro del rango típico de los aciertos iniciales con fragmentos. Una estructura de cocristal por rayos X, que muestra cómo se acomoda una molécula dentro de una proteína, también situó un compuesto en la entrada del bolsillo de unión del sustrato y del NAD de la enzima.

Original · inglés

Kim is careful about what these results are. The best-known DHPS inhibitor closely mimics a natural molecule in the cell, which carries a risk of acting on the wrong targets. The new hits are built on unrelated scaffolds, and small fragments of this kind leave room to be grown into more potent compounds. "However, these molecules are early-stage hits rather than drug candidates," he said. The team says further studies are needed on the inhibition mechanisms, selectivity, cellular activity, toxicity and performance in animal models.

Traducción · español

Kim es cauteloso sobre lo que significan estos resultados. El inhibidor de DHPS más conocido imita de cerca una molécula natural de la célula, lo que implica el riesgo de actuar sobre dianas equivocadas. Los nuevos aciertos se basan en estructuras químicas sin relación entre sí, y los fragmentos pequeños de este tipo permiten hacerlos crecer hasta obtener compuestos más potentes. «Sin embargo, estas moléculas son aciertos en fase temprana y no candidatos a fármaco», afirmó. El equipo indica que harán falta más estudios sobre los mecanismos de inhibición, la selectividad, la actividad celular, la toxicidad y el comportamiento en modelos animales.

Original · inglés

For now, the gain is a method. The pipeline is freely available, and its modest computing requirements could let laboratories with limited computational resources run experimentally grounded AI-assisted drug searches. The team says it could be applied to other disease targets. For patients, the study offers no timeline and no drug: it is a proof of concept that a predicted molecule can be confirmed in a test tube, and the work that separates that from a treatment has not been reported.

Traducción · español

Por ahora, la ganancia es un método. El flujo de trabajo está disponible de forma libre, y sus modestos requisitos de cómputo podrían permitir que laboratorios con recursos computacionales limitados realicen búsquedas de fármacos asistidas por IA y basadas en experimentos. El equipo afirma que podría aplicarse a otras dianas de enfermedades. Para los pacientes, el estudio no ofrece plazos ni fármaco: es una prueba de concepto de que una molécula predicha puede confirmarse en el tubo de ensayo, y no se ha informado del trabajo que separa eso de un tratamiento.

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