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A tumor's DNA can look like a record of the damage it has accumulated. Researchers from the University of California San Diego and collaborators have now identified a previously overlooked mutational signature—a recurring pattern of DNA mutations—in colorectal cancer. Mariya Kazachkova and colleagues found it across three independent datasets containing 2,616 tumors.
L'ADN d'une tumeur peut ressembler à l'enregistrement des dommages qu'elle a accumulés. Des chercheurs de l'Université de Californie à San Diego et leurs collaborateurs ont maintenant identifié une signature mutationnelle auparavant négligée — un profil récurrent de mutations de l'ADN — dans le cancer colorectal. Mariya Kazachkova et ses collègues l'ont retrouvée dans trois jeux de données indépendants contenant 2 616 tumeurs.
The pattern was not entirely new to cancer genomics. It had already appeared in large collections of tumor genomes, but researchers had interpreted it as a combination of other, known signatures. A closer analysis found that it did not match the biological processes previously associated with those signatures, separating it as a distinct signal. The work was carried out by Team Mutographs, which studies how mutation patterns relate to cancer development.
Ce profil n'était pas entièrement nouveau dans le domaine de la génomique des cancers. Il était déjà apparu dans de vastes collections de génomes tumoraux, mais les chercheurs l'avaient interprété comme une combinaison d'autres signatures connues. Une analyse plus approfondie a montré qu'il ne correspondait pas aux processus biologiques précédemment associés à ces signatures, ce qui a permis de l'identifier comme un signal distinct. Ces travaux ont été menés par Team Mutographs, qui étudie les liens entre les profils de mutations et le développement des cancers.
The timing adds another clue. The signature appeared relatively late during colorectal tumor development, suggesting that something changes as the tumor grows and causes cancer cells to accumulate a new form of DNA damage or copying error. Tumors carrying the pattern also had more small insertions and deletions—short stretches of DNA added or lost—which can arise during DNA replication and repair.
Le moment de son apparition apporte un autre indice. La signature est apparue relativement tard au cours du développement des tumeurs colorectales, ce qui suggère qu'un changement survient à mesure que la tumeur croît et amène les cellules cancéreuses à accumuler une nouvelle forme de dommage à l'ADN ou d'erreur de copie. Les tumeurs présentant ce profil comportaient également davantage de petites insertions et délétions — de courtes séquences d'ADN ajoutées ou perdues — qui peuvent survenir lors de la réplication et de la réparation de l'ADN.
And so, concretely? Researchers gain a more precise way to investigate what happens inside some colorectal tumors as they evolve. The study therefore adds a clue for investigating the processes that shape colorectal cancer development.
Et concrètement ? Les chercheurs disposent d'un moyen plus précis d'étudier ce qui se passe à l'intérieur de certaines tumeurs colorectales au cours de leur évolution. L'étude apporte donc un indice supplémentaire pour analyser les processus qui façonnent le développement du cancer colorectal.
The result is a finding about tumor biology. Its strength is the recurrence of the pattern across 2,616 tumors and independent datasets; the findings provide an additional clue that the pattern may be related to DNA replication and repair.
Il s'agit d'un résultat portant sur la biologie des tumeurs. Sa force tient à la récurrence du profil dans 2 616 tumeurs et dans des jeux de données indépendants ; ces résultats fournissent un indice supplémentaire laissant penser que ce profil pourrait être lié à la réplication et à la réparation de l'ADN.