Des marqueurs génétiques mesurent les lésions rénales et hépatiques

Des chercheurs de Cologne ont développé une méthode assistée par ordinateur qui utilise des marqueurs d’expression génique pour quantifier les lésions de cellules rénales et hépatiques individuelles, rendant ces variations visibles.

L’équipe réunit des travaux de l’Université de Cologne, de l’hôpital universitaire de Cologne et de l’Institut Max-Planck de recherche sur le métabolisme. Dirigé par le professeur Andreas Beyer du pôle d’excellence CECAD consacré à la recherche sur le vieillissement, avec le néphrologue Dr Martin Kann, le projet se concentre sur les podocytes du rein et les hépatocytes du foie, des types cellulaires liés aux maladies liées à l’âge.

L’approche fonctionne avec le séquençage de l’ARN unicellulaire, qui mesure l’activité des gènes une cellule à la fois, ainsi qu’avec des données de transcriptome spatial provenant de tissus. En identifiant des gènes marqueurs, l’ordinateur peut classer les cellules selon les dommages qu’elles ont subis, puis examiner les processus biologiques qui se déroulent successivement.

Cette séquence constitue le principal gain pratique. La méthode est conçue pour distinguer les mécanismes précoces de la maladie des changements plus tardifs et pour différencier l’évolution propre à chaque patient des tendances générales de la maladie. Ces signaux pourraient aider les chercheurs à identifier les stades auxquels une intervention serait la plus efficace et favoriser des traitements mieux adaptés à chaque cas.

Et concrètement ? Cette technique permet aux scientifiques d’étudier l’évolution d’une maladie au sein d’un échantillon de tissu individuel, plutôt que de s’appuyer uniquement sur une moyenne pour l’ensemble du tissu. Il s’agit encore d’une méthode de recherche : les équipes de Cologne la perfectionnent pour mieux prédire l’évolution des maladies chez les patients. Les résultats ont été publiés dans Cell Genomics.